En el tomo anterior, veíamos como la Brigada Dai-Gurren se disponía a asaltar la ciudad de Teppelin, capital de los hombres bestia y guarida de Lord Genome, el Rey Espiral. Tras una dura batalla contra el Lazengann de Lord Genome, en el que el Gurren Lagann se ve superado, Simon termina con el Rey Espiral empleando la broca de núcleo, y la humanidad logra hacerse con la victoria.En este tomo veremos las consecuencias de esta victoria. Tras 7 años, los humanos han vuelto a habitar la superficie. La destruida Teppelin ha sido reconstruida y renombrada como Kamina City, ahora capital de la humanidad, y Simon, Rossiu y el resto de miembros de la Brigada Dai-Gurren ocupan altos cargos del nuevo gobierno (a excepción de Yoko, quién decidió separarse del grupo hace 6 años para ejercer como profesora de educación primaria en una isla remota).
La vida sonríe a los nuevos habitantes de la superficie, y la paz ha logrado que humanos y hombres bestia olviden sus diferencias. Pero un peligro del pasado amenaza de nuevo a los descendientes de la raza espiral. Un peligro del que el mismo Lord Genome ya les advirtió hace 7 años. Se acercan los anti-espirales...